早在1935年10月，時任中共陝甘邊根據地蘇維埃政府主席習仲勛就曾在「陝北肅反」時，被當成「反革命頭目」——右派前線委員會書記，差點被活埋。當時，原紅26軍營以上幹部和西北軍委機關、陝甘邊縣委書記和縣蘇維埃主席以上的幹部幾乎全部被捕，230多人被殺害！

習仲勛被誘捕後，最初關在王家坪，後來押往中共陝甘晉省委駐地瓦窯堡。押解途中，給他頭上套了一個只露兩隻眼睛的黑帽子，肩上還讓扛了兩桿長槍。習仲勛後來談及這段往事時說：「晚上睡覺時仍將人捆著，腳上、脖子上也加了繩子。『左』傾機會主義路線的執行者搞法西斯審訊方式，天氣很冷，不給我們被子蓋，晚上睡覺捆綁著手腳，繩子上都長滿虱子；一天只放兩次風，有人拿著鞭子、大刀，看誰不順眼就用鞭子抽，用刀背砍」。在黑監獄外邊，已經挖好了活埋他們的坑。

1962年9月召開的中共八屆十中全會上，時任中共黨魁毛澤東大談特談階級鬥爭，指出：階級鬥爭必須年年講、月月講、天天講！時任中共政治局候補委員康生提出了小說《劉志丹》的問題，他遞了一張條子給毛澤東，上面寫道：「利用小說搞反黨活動，是一大發明。」毛澤東馬上在會上念了這張條子，然後說：「凡是要推翻一個政權，總要先造成輿論，總要先做意識形態方面的工作，革命的階級是這樣，反革命的階級也是這樣。」在這次中央全會上，習仲勛等被指責為小說《劉志丹》的幕後策劃者。毛澤東決定成立由20人組成的清查習仲勛等人反黨活動的專案審查委員會。從此，為中共出生入死34年的習仲勛，被打成「習仲勛反黨集團」的總頭目。

這部小說為什麼會引起毛澤東如此強烈的反應呢？關鍵在於，毛澤東不擇手段顛覆中華民國政權後，時刻擔心有人顛覆他的最高統治權。1955年，毛澤東利用「企圖推翻以毛澤東為首的中共領導核心」這一駭人聽聞的罪名，清洗了中共黨內第一個「反黨集團」——高崗、饒漱石反黨聯盟。高崗是陝北人，中共陝北根據地的創立者之一，後任中央政府副主席、軍委副主席、國家計委主席。1954年8月17日，高崗呑服大量安眠藥自殺。1959年7月的廬山會議上，又冒出了一個敢給毛澤東上「萬言書」講真話的彭德懷。在7月27日的會議上，情緒激動的毛澤東厲聲說道：「我曉得你彭德懷從延安整風以來就不服氣，憋了那麼久，這次就發到廬山上來了。好傢夥，簡直要把漢陽峰推下去！你我共事30年，你是三分合作七分不合作……你罵了20天，指名道姓，喋喋不休，還要怎麼樣了？」盛怒之下，毛澤東又清洗了一個反黨集團——「彭德懷反黨集團」。

會議決定撤銷彭德懷、黃克誠、張聞天和周小舟分別擔任的國防部長，中央書記處書記、總參謀長，外交部第一副部長，湖南省委第一書記職務。此後，全國開展了聲勢浩大的「反右傾機會主義運動」，全國被重點批判和劃為「右傾機會主義分子」的幹部和黨員300多萬，從上到下被批判的可能有幾千萬。1959年至1962年，全國餓死老百姓3755.8萬！彭德懷曾任中共西北局第一書記，習仲勛曾任西北局第二書記。彭德懷被打倒後一直不服，一直在申訴。《劉志丹》這部小說，宣揚劉志丹，讓被吹捧為「中國人民大救星」的毛澤東心裡很不爽，書中還有宣揚已被打倒的高崗的內容，讓毛澤東更加不爽，加上被打倒的彭德懷寫了長達8萬字的申訴信，要求重新審查他的歷史問題，讓毛澤東非常非常不爽。打倒習仲勛，徹底整掉一批西北地區的官員，成了毛澤東階級鬥爭的新目標。

小說《劉志丹》被認為是習仲勛等反革命分子向黨發動猖狂進攻的一支「大毒箭」。「習仲勛反黨集團」，後來被升級為「彭德懷、高崗、習仲勛反黨集團」、「西北反黨集團」，由此株連了一大批曾在西北工作過的各級各類官員。原國家經委副主任賈拓夫被撤職、下放，1967年5月7日被迫害致死。1968年5月，劉志丹的弟弟、地質部副部長劉景范，被以「現行反革命分子」逮捕，非法關押7年。1968年1月，作者李建彤被抓捕，1970年被開除黨籍，強制勞動改造。1968年1月，時任勞動部部長馬文瑞被捕入獄，坐牢5年。1964年8月，習仲勛少年時代的同學、西北農學院總務科科長田屏軒，因不堪忍受非人的折磨，不願說假話對習仲勛落井下石，跳進渭河自殺。西北地區大部分司局長以上官員被株連，打倒了幾百人。最基層幹部群眾，上萬人被打成「彭、高、習反黨集團」的黑爪牙，甚至李建彤到陝北採訪時為她帶過路的老百姓也被打死好幾個。該事件前後株連迫害高達6萬人，連死去的劉志丹也不能倖免，被打成「叛徒」。

當年栽贓陷害習仲勛有許多荒謬至極的事，比如說習仲勛跟某個女演員上床等。那些無恥的細節，我在這裡都不願意多寫一個字，只講一件惡劣事：高崗後妻李力群1959年在廬山會議期間揭發習仲勛跟高崗「密」的萬言信，到1962年9月，又被翻出來了。3年前，因為這封信完全是胡編亂造，毛澤東根本沒有拿它當回事。現在，習仲勛成了新的鬥爭目標，這份揭發材料一下子變成了至寶。高崗被打成反黨集團後，先後三次自殺。第一次自殺未遂後，習仲勛受周恩來委託跟高崗談過一次話，這是在毛澤東已決定打倒高崗的情況下的一次談話，習仲勛能不慎之又慎嗎？而李力群揭發習仲勛對高崗說的話，全是煽動高崗不滿、促使高崗自殺的言論。李力群甚至揭發說，高崗死後，習仲勛把一支手槍交給高崗前妻之子高毅，要他為高崗報仇。真有這樣的事，習仲勛有一百個腦袋，也可能早就全部搬家了。任何一個對中共政治生態有一點點常識的人，絕對不會相信這些胡言亂語。然而，這封「滿紙荒唐言」的信，卻成了置習仲勛於死地的重磅炸彈。

「這真是晴天霹靂，令人百思不得其解。」習仲勛後來寫道。這場從天而降的大災難，使他陷入極端苦惱之中。習仲勛回家後，整天沉默不語，暗自傷神。之後，被勒令停職審查3年多。1965年12月，根據周恩來的建議，習仲勛被下放到河南省洛陽礦山機器廠擔任副廠長，參加車間生產勞動。1967年1月，西安的一批紅衛兵從康生那裡得知習仲勛下落後，立即驅車趕到洛陽，將習仲勛劫持到陝西，在西安、閻良、富平等地，批鬥、遊街示眾。1967年9月的一天，習仲勛被軍管人員押到西北農學院批鬥。在一片「打倒反革命修正主義分子習仲勛」、「三反分子習仲勛不投降就叫他滅亡」的口號聲中，習仲勛脖子上掛著「反黨分子習仲勛」的牌子，被一幫造反派反扭著胳膊，揪著頭髮，推搡到了台上。在造反派聲嘶力竭的批鬥過程中，習仲勛被後面的造反派一次又一次把頭按下去，他還是慢慢往上抬，抬起來一點又被粗魯的按下去，時不時還被拳頭狠捶幾下……

1968年1月，習仲勛被押回北京，關在一個七八平米的小屋子裡，由北京衛戍區監管起來。這一關，就是整整8年！孤獨寂寞中，習仲勛為了鍛練身體和意志，每天堅持做兩次斗室轉圈，先邁步正著轉圈，從1數到10000，然後退步倒著轉圈，從10000倒數到1。1971年9月13日，中共第二號人物，被寫進黨章的接班人林彪死了。中國冷酷的政治環境略有鬆動。1972年冬，習仲勛夫人齊心給周恩來寫信說：我和孩子們已多年未見到習仲勛了，請求總理讓我們母子早日見到他。這封信很快有了回音。一家人終於久別重逢。習仲勛的小兒子習遠平回憶說：「父親與全家人相互打量著，見到我時，他問的第一句話竟然是：『你是近平還是遠平？』聽到他這樣問我，大家都哭了，父親的淚水也奪眶而出。」

1975年1月，在「文革」初期被打倒的鄧小平，復出主持中央工作。1975年5月，習仲勛被「解除監管」，下放到洛陽耐火材料廠。據習仲勛的一位忘年交楊屏回憶，1976年6月15日晚，被迫害達15年之久的習老爺子，回顧自己蒙冤落難以來，兒子習近平受牽連遭受的種種苦難，心中無限悲涼，禁不住淚流滿面。緩了好長時間，才泣不成聲地說：「今天是你近平哥哥的生日，你來陪我喝點酒，給他過個生日。」說話間，淚珠順著臉頰滴落在桌子上。然後，抬眼看著楊屏說：「你爸爸比我好哇，把你照顧得這麼好。我也是當爸爸的，因為我，你近平哥哥可是九死一生啊！」那天晚上，習老爺子一邊哭著，一邊不斷地重複說：對不起孩子們，對不起家裡所有的人。

習仲勛被打倒時，習近平才9歲，曾經的高幹子弟，一下子變成「狗崽子」、「黑五類」（地主、富農、反革命、壞分子、右派），時時處處受歧視。15歲時，因受父親問題的牽連，被有關部門多次關押審查，出來時，身體非常虛弱，全身都是虱子。後來到陝西富平老家大姑家休養了很長時間，大姑一天一碗鮮羊奶餵著，才慢慢調養好。1969年1月，未滿16歲的習近平到陝北延川縣梁家河生產大隊插隊，一去就是近7年。習近平寫道：「回想我剛下鄉的時候，大概有二、三十個知識青年，都是軍隊幹部子弟，半年後大部分都當兵走了。近一年時間裡就我一個堅守在那裡，感到十分孤獨。」「我先後寫過十份入黨申請書，由於家庭的原因，都未獲批淮。」弟弟習遠平去看他時，僅一天就起了渾身水皰，原來，習近平為防虱子、跳蚤、臭蟲咬，在炕席下灑了厚厚一層666粉，他一年四季就睡在這樣的炕席上。習近平一再叮囑弟弟回家後不要告訴媽媽。但媽媽還是知道了，因為習遠平渾身爛得血肉模糊的，媽媽一眼就看出來了，母子倆抱頭痛哭。

1976年10月6日，毛澤東死後不到一個月，毛澤東的妻子江青等「四人幫」被抓捕，給中華民族帶來深重災難的十年文化大革命終於結束。1976年11月15日，1977年8月21日，8月24日，習仲勛先後3次致信中央領導，請求對他的問題進行複查，並請求出來工作。習仲勛的夫人齊心看到一些受過迫害的老幹部紛紛恢復工作，習仲勛的問題在「四人幫」被抓之後一年多還未得到解決，心急如焚。她在女兒橋橋的陪伴下多次往返於北京、洛陽之間，找中共元老王震、葉劍英，找新上任的中共中央組織部部長胡耀邦，最後，是在鄧小平批示下，胡耀邦開始複查習仲勛反黨集團案。1978年2月，習仲勛終於迎來了人生的重大轉折點，中央領導決定將他接回北京，作為特邀委員出席中共政協第五屆全國委員會第一次會議。同年4月，習仲勛恢復工作，擔任中共廣東省委第二書記。習仲勛被打倒時，49歲，正是年富力強時，1978年4月復出工作時，已經65歲！期間，16年的寶貴時光，是在政治生命被毛澤東判死刑的漫漫長夜中度過的！

1979年8月4日，中共中央批轉了中央組織部《關於為小說〈劉志丹〉平反的報告》。報告指出：《劉志丹》不是反黨小說，小說的創作過程是正常的，沒有什麼陰謀，習仲勛對如何修改好這部小說發表過意見，是完全正當的，根本談不上是什麼反黨陰謀集團活動；沒有根據說習仲勛等在此書創作過程中結成「祕密反黨集團」；從案件前後經過看，所謂利用寫《劉志丹》小說進行反黨活動一案，是康生製造的一起大冤案；「文化大革命」中，康生等人變本加厲，搞出一起株連甚廣的現代文字獄，為此，凡因小說《劉志丹》案受到迫害、誣陷和株連的一切人員，都應恢復名譽，給予平反。這個平反報告，將毛澤東應當承擔的歷史責任全部推到了康生身上。康生是1975年12月16日在北京病死的，中共中央發布的訃告中稱他為「中國共產黨的優秀黨員，是中國人民的偉大的革命戰士和馬克思主義理論家，是黨和國家卓越的領導人之一、中國人民的偉大的無產階級革命家，光榮的反修戰士」。當時，毛澤東還在世。這個評價就是毛澤東對康生的評價。如果不是百分之百對準毛澤東的心思，並得到毛澤東的全力支持，康生決不敢對習仲勛說三道四。打倒習仲勛，毛澤東實負有最大的不可推卸的領導責任。

從1978年4月復出到1993年3月退休，習仲勛當過廣東省委第一書記，中央書記處書記，中央政治局委員，全國人大副委員長。這期間，還有一件與習仲勛挨整16年密切相關的事值得一提。這就是晚年的習仲勛，一直念念不忘起草制定一部《不同意見保護法》。1981年，習仲勛擔任人大副委員長時還兼任全國人大法制委員會主任。當時在法制委員會下面的「民法、國家法室」工作的高鍇，說他對習仲勛印象最深的，就是他多次跟大家講要保護和尊重不同意見。在一次討論會上，習仲勛說：「我長久以來一直在想一個問題，就是怎樣保護不同意見。從黨的歷史看，不同意見惹起的災禍太大了！『反黨聯盟』、『反革命集團』、『右傾投降』、『左傾投機』等等，我經歷過的總有幾十起、上百起，但最後查清楚，絕大多數是提了一些不同意見，屬於思想問題，有不少意見還是正確的……因此，我想，是否可以制定一個《不同意見保護法》，規定什麼情況下允許提出不同意見，即使提的意見是錯誤的，也不應該受處罰。」