【大紀元2023年09月02日訊】(大紀元記者林達編譯報導)兩項關於人類男性染色體的新研究揭示了令人驚訝的多樣性,並最終完成了人類基因組測序。
對 Y 染色體進行全面測序一度被認為是一項不可能的任務。這個構成男性的特徵染色體充滿了重復和倒置的 DNA 片段,這使得將測序後的 DNA 片段以正確的順序組合起來具有挑戰性。8月23日發表在《自然》雜誌上的兩篇論文稱,研究人員利用最先進的技術,不僅僅針對一條 Y 染色體進行了測序,而是成功地對來自世界各地男性的數十條 Y 染色體進行了測序,完成了期待已久的人類基因組完全測序目標的最後一步。
詳細介紹了重復區域的排列方式並鑒定了數十個新基因;則揭示了這種排列以及基因的數量在人與人之間存在巨大差異。
未參與這項工作的魯汶大學遺傳學家托馬斯‧基維斯爾德 (Toomas Kivisild)表示,這一成就「代表了令人印象深刻的結局,從而標誌著人類遺傳學全新時代的開始」, 「這兩項研究開始揭示不同個體之間差異的規模。」
科學家相信 Y 和 X 染色體曾經是相同的。隨著時間的推移,Y染色體中含有基因的部分縮小到 X 中該區域大小的六分之一,而它所包含的基因數量是其X的對應區域的一半。一些研究人員認為,這種退化可能會逐漸持續下去,可能導致 Y 染色體完全消失。
儘管 Y 染色體很小,但很難對其進行測序。人類基因組測序的第一次嘗試甚至不包括 Y,部分原因是,人們曾認為它是注定要消失的。此外,它的重復區域使其成為「基因組中最麻煩的染色體」,沒有參與這項新工作的deCODE Genetics公司的生物人類學家阿格納爾‧赫爾加森(Agnar Helgason)說。
最終,一組研究者對 Y染色體的一部分進行了測序,並了解到它是非常活躍的,即Y染色體會在不同DNA片段的鏡像中複製多個拷貝。通過以這種方式構建自身,染色體能夠使其所含有的少數基因保持完好。
今年三月,國家人類基因組研究所的生物信息學家亞當‧菲利普(Adam Phillippy)和「端粒到端粒聯盟」(Telomere-to-Telomere consortium,T2T)描述了除 Y 染色體外的人類基因組的完整測序。當時,該聯盟在推特上表示,已經掌握了 Y染色體基因序列。現在,該團隊詳細分析了 Y 染色體 6200 萬個鹼基的複雜排列,添加了之前部分測序嘗試中缺失的 3000 萬個鹼基。
「這有點像高清電視——我們以前可以看到圖像,而這些研究將其置於超清晰的焦點中」,沒有參與這項工作的萊斯特大學遺傳學家馬克‧喬布林(Mark Jobling)說。
在菲利普合著的第二篇論文中,傑克遜基因組醫學實驗室主任、遺傳學家查爾斯‧李(Charles Lee)及其同事對來自世界各地 21 個不同人群男性的 43 條 Y 染色體進行了測序,這些21個不同的人群先前被確定為「千人基因組計劃」(1000 Genomes Project)的一部分,該計劃採樣了人類之間的遺傳差異。
他們發現,Y染色體具有很大差異性。 「我很驚訝地發現 Y 染色體上某些基因的拷貝數量的差異程度」,李說。例如,一名男子的 Y 染色體有 23 個名為 TSPY 的基因拷貝,該基因被認為與精子的形成有關,而另一名男子的 Y 染色體則有 39 個此基因的拷貝。
該研究還發現Y染色體大量重復區域的大小和組成也存在差異。這種所謂的異色塊(heterochromatic block)在不同男性中的長度從 1760 萬到 3720 萬個鹼基不等。它是人類基因組中最大的此類鹼基塊。這個片段中的重復似乎並不像一些人想象的那樣完全隨機,而是具有重復 DNA 片段的獨特模式。
喬布林說,這樣的DNA組織和保存程度表明 Y 染色體並未因退化而逐漸消失。他說,這篇「論文證實了 Y 染色體的基因內容本質上是保守的」,「Y 仍在退化並注定要消失的觀點真的被這一點徹底擊垮了。」
截止目前,尚不清楚所有這些差異性是否會影響男性的生育能力或其它特徵。但赫爾加森說,知道它的存在「為後續研究奠定了基礎」。例如,現在可以進行大規模研究,看看 Y 染色體的差異如何與健康問題相關,包括與 Y 染色體有關的某些類型的癌症,如膀胱癌。 Y染色體「研究起來仍然非常棘手,但至少我們知道棘手的部分在哪裡」,他說。◇
責任編輯:孫芸#