免疫指标的检查在红斑狼疮中十分重要，通常经由抽血检查‘自身抗体’以及‘非抗体’的免疫指标。
一、自身抗体
所谓自身抗体就是身体自己产生的抗体。在自身抗体中以抗核抗体(ANA)最为重要，其他还包括抗中性粒细胞胞浆抗体、抗心磷脂抗体等在此就不再赘述。
(一)抗核抗体
在过去传统意义上把抗细胞核内的抗体称为抗核抗体(anti-nuclear antibody，ANA)。近年来，随着分子生物学、细胞生物学、免疫化学的深入研究，目前对ANA不再只是粗略的针对细胞核成分，而是更细微的指抗核酸(nucleic acid)和核蛋白(nucleoprotein)抗体的总称，现在已发现不同意义的二十余种ANA，而形成抗核抗体谱(ANAs)。
1．抗核抗体：ANA是对各种细胞核成分所产生抗体的总称，属于自身抗体。检测ANA对红斑狼疮的诊断、分型和治疗，有着十分重要的意义。据统计：抗核抗体在系统性红斑狼疮活动中的阳性率可达96％-100％，在非活动期的阳性率为80％-100％。
ANA浓度高未必表示SLE在活动，也不一定是治疗的指标。ANA的出现无特异性，其他胶原性疾病(Collagen Disease)，如硬皮病(Scleroderma)、类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis)、混合性结缔组织病(Mixed Connective Tissue Disease)、干燥综合症(Sjogren’s syndrome)等，亦可出现ANA阳性，但一般来讲，它们的阳性率以及滴定度均较低。
2．抗DNA抗体：主要是检测抗双链DNA(double stranded DNA，ds－DNA)抗体。抗双链DNA抗体(anti-dsDNA)主要见于SLE，是SLE的高度特异性抗体，是SLE组织损伤的发病基础，也是疾病活动的标记，特别与活动性肾损伤密切相关，是SLE诊断标准条件之一。
在SLE病变中，anti-dsDNA的阳性率为60％-90％，与SLE的活动性成正相关，而在活动性SLE的阳性率为80％－100％；在非活动期阳性率<30％，诊断特异性为90％，即anti-dsDNA阳性有九成机会是红斑狼疮。在临床上高滴度的anti-dsDNA常提示SLE的诊断，但低滴度anti-dsDNA也可见于肝病、青年型类风湿性关节炎及某些正常人群。在临床上anti-dsDNA可用于监测SLE的病情变化，其滴度的降低或消失常提示疾病的好转或缓解，如果进行治疗后其滴度不下降反而上升，常预示着患者的肾脏损害进一步加重。
3．抗ENA抗体：抗ENA抗体是一种针对细胞核内可提取核抗原(extractable nuclear antigen，ENA)的自身抗体，最主要是检测抗Sm抗体(Anti-Sm autoantibodies〉，对疾病的诊断、治疗及预后的判断有重要的意义，但与疾病的活动性以及疾病的严重程度无正相关。
4．抗Sm抗体：抗Sm抗体〈Anti-Sm autoantibodies〉，首先是在一个名叫Smith病人的血清中所证实，故称之为抗Sm抗体，对诊断SLE有高度特异性，是SLE的标记性抗体，即发现抗Sm抗体，几乎可以确诊为系统性红斑狼疮了。
在SLE患者中阳性率因人种而不同，黑人和亚洲人的SLE患者中阳性率较高，可达30％—40％，而白种人的患者阳性率却只有10％—20％；平均阳性率约为25％。抗Sm抗体对SLE有很强的特异性，特别是对伴有中枢神经症状者阳性率更高，但它与疾病的活动性不呈正相关，经治疗后也可以不消失。
二、非抗体免疫指标
(一)补体(Complement，简称C)
补体是存在于人血清中的具有脢活性的球蛋白，占球蛋白总量的10％～15％，它由9种血清蛋白(C1-C9)和一些相关物质组成，参与身体正常免疫反应。SLE患者补体受到启动，参与免疫反应，因而补体有所降低。补体成分的降低常标志着病情处在活动期，常有肾脏炎、溶血性贫血、关节炎等急性的临床症状出现。血清中C3是补体中的一种成分，它的含量最高，可占补体总数的50％以上，如果检测C3和anti-dsDNA浓度在正常的范围，常表示着疾病处在非活动期，预后良好。
如果检测患者的补体，如C3、C4降低，或anti-dsDNA升高，常预示着SLE处在病情加重的状态。C4的水平下降与狼疮性肾炎有密切的关系。C4的降低常先于C3，并且在长时间内保持低浓度，尤其是在病情恶化前，C4先下降，继而C3也随之下降。这种变化，对病情的诊断，疗效的判定和预后都有十分重要的意义。
但在临床上也发现，有部分SLE患者虽然长期有低补体浓度，即C3、C4很低。但病人的病情稳定，处于良好的状态，反之，也有少数患者，病情处在进行性加重，但补体C3、C4却持续正常，无变化。
(二)类风湿因子(Rheumatoid Factor, RF)
类风湿因子是一种巨球蛋白的自身抗体，简称RF。在临床上约有33％～61％的SLE患者会出现RF阳性，但与类风湿关节炎相比，其滴度较低且不持久。◇
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