【大紀元11月3日報導】（中央社記者溫貴香台北三日電）檢調偵辦總統府國務機要費案，全案今天偵結，總統夫人吳淑珍、前總統辦公室主任馬永成等六名被告，分依貪污、偽造文書、偽證等罪嫌起訴、緩起訴。全案偵辦過程中，總統陳水扁以及總統府相關說明重點如下：

–七月十九日，總統府表示，國務機要費核銷，一向依法定會計、審計程序處理，並無所謂貪瀆情事。為杜絕訾議，府方將邀集相關單位協商，建立更透明制度。

–七月二十一日，總統府秘書長陳唐山表示，總統運用國務機要費及相關核銷作業，沿用舊制、合乎制度，絕無貪瀆或違法，府方絕沒有理由作假。府方會配合審計、司法機關調查。

–七月二十七日，審計部將國務機要費案送交檢調單位調查，總統府尊重並將配合相關司法調查。

–七月二十八日，總統府發表四點聲明表示，希望國人瞭解並尊重國家元首推動國務機要工作的必要性及複雜性。總統府絕對尊重審計部的審查，並配合檢調單位進行調查，以釐清絕無違法貪瀆的情事，並儘速還原事實真相。

–七月三十一日，總統府表示，為杜絕外界疑義，總統陳水扁樂於以負責任態度親向檢調單位說明。總統與部分民進黨立委會面，與會者轉述，總統表示，國務機要費沒有流入私人口袋，皆用於國務上，他願以負責任的態度向台灣高等法院檢察署說明。

–八月十二日，總統表示，國務機要費或官邸用人問題，就是轉型期的後遺症，過去可以，現在不可以，這就是進步，一些東西要改，但在改的過程中不能有雙重標準，說過去不對，可以原諒，現在不可以，就說成這是特權和貪污。

–九月一日，高檢署查緝黑金行動中心追查總統府核銷的國務機要費單據，發現二00三年至二00五年間，有一千零二十萬元的SOGO禮券核銷單據核銷「品名」不明確，總統府表示，國務機要費相關支出，絕無不法。

–九月五日，總統陳水扁在帛琉表示，國務機要費全部用在公的方面，絕對沒有納入私人口袋，不管總統府或他，都配合司法調查，相關經費的使用、用在哪裡，包括一些領據與匯款都向查黑中心檢察官說明。

–九月七日，總統府表示，總統在八月七日在總統府內向檢方說明國務機要費的性質、功能及其演變沿革，並對經費用途及支出作詳細說明，同時提供檢方領據及匯款單等資料，強調絕未納入私人口袋。

–九月八日，總統府發表聲明表示，陳總統及夫人分別面對檢調詢問時，均坦蕩面對、詳予說明，並提供相關物證釐清案情；兩人均強調國務機要費完全是用於公務方面，絕無不法，更未流入私用。

–十月二日，總統府副秘書長卓榮泰表示，總統府自今年九月起取消以往用領據支領國務機要費半數的作法；涉及機密部分，依照國家機密保護法規定處理，使國務機要費的執行更符合制度化與透明化。

–十月二十三日，國家安全會議秘書長邱義仁表示，檢察官陳瑞仁還在調查國務機要費案，大家應該相信司法，少評論審判中或調查中的案子，總統已說過只要他本人或總統夫人吳淑珍涉及弊案，會下台負責。

–十月二十四日，邱義仁接受中央社訪問表示，高檢署查黑中心檢察官陳瑞仁偵辦國務機要費案的調查進度與內容，他完全沒有任何訊息，他打從心裡相信司法，相信總統絕對沒有貪瀆與中飽私囊。