第六集無奈的甲基化
「大瘟疫救助基金會」的資助款一個星期後撥下來。
萬事俱備,林凱文教授的科研團隊立刻著手收集基因甲基化檢測樣本,他同時邀請了麻省理工學院和加州大學伯克利分校等幾個實驗室,聯合進行此項研究。他們從X染色體的1672個基因中,劃出一半,接近804個,挑出黑猩猩沒有的人類特有基因185個。研究範圍非常明確,簡單,大大減少了實驗室裏研究的工作量。不過要對特定位點的甲基化定量觀測,描繪出每個基因的甲基化曲線,而且樣本數量以萬計,任務自然繁重艱巨。研究甲基化的方法眾多,但都存在一定的局限,導致定量測量難度大。利用Frommer等人提出的直接測序法顯然是上佳方法,可靠性及精確度很高,能明確目標片段中每一個CpG位元點的甲基化狀態,可惜需要大量的克隆測序,過程較為繁瑣、昂貴。Eads等人發明的螢光法也非常不錯,具有高敏感、快速的特點,缺點也是費用高,測定每個位點都要用兩端標有螢光素的探針和一對引物,且受較多因素影響。
凱文教授及時把研究的技術瓶頸問題和瑪洛麗夫婦溝通,瑪洛麗和希亞幫凱文找到了解決之法:不需要考慮昂貴的因素;測量過程繁雜,可以要求眾多實驗室共同協助。瑪洛麗明確表示,爭取一年時間內完成測序工作,研究經費上限為兩億美元。
凱文開心極了,因為這樣一來,他可以更多的考慮樣本採集和測試結果分析,而不是瑣碎的試驗重複工作。
按研究計畫,需要收集一萬個樣本,每份樣本都有詳細的檔案,為了減少干擾,要求來自健康的志願者。提到「純潔」的人,凱文首先選擇了宗教團體,五六十歲的中老年人是他的首選,因為這些人相對而言更傳統、守道德。當然,年輕人和婦女構成第二部分,六歲到十八歲的少年構成第三部分。非「純潔」的人,他首選監獄中的年輕人,第二部分是中老年人,第三部分是女人。種族和教育程度也適當分配;城市和鄉村也要比列均衡,東部和西部也必須擁有同樣的代表者。凱文希望這份萬人基因甲基化樣本有足夠的普遍性代表全人類。
光陰似箭,轉眼一年過去了。
研究測試進展順利,在近10個研究實驗室1000餘名科學家的努力下,2011年7月20日,X染色體人類特有基因的「萬人基因甲基化測試」已告尾聲。利用超級電腦,凱文教授整理出測試結果分析報告。
在人類特有的185個基因中,從abcd1ATP、ebpemopamil、loc646469到mrx84、vcx-c、zdhhc10,一萬個人的基因甲基化曲線圖,在相同的一些基因位點上,可以看到甲基化的程度截然分成了兩部分,人數比例大致為20:80。凱倫斷定,這就是「純潔」的人和非「純潔」者兩大陣營的識別瘟疫病毒基因表達的分化,每十個人中僅有二個「純潔」的人,也就是說,如果現在滅世大瘟疫病毒流行,全世界70億人會只剩下14億,相當於半個中國的人口。美國3億多,將僅有7000萬倖免於難。
「請問林教授,我的基因表達歸入哪類?」當凱文第一時間把科研報告送到基金會總部時,瑪洛麗迫不及待的問道,這也是希亞的問題。
「很遺憾,我在『純潔』資料庫中沒搜索到您的名字。希亞先生也沒有。其實我也不屬於『純潔』者,我妻子也一樣。」凱文有點尷尬的說明。
「真是可怕,我們居然是非『純潔』者。」瑪洛麗喃喃說:「我真想知道『純潔』的人什麼樣。」
「非常奇怪,經過身分分析,『純潔』和非『純潔』似乎不按我們通常劃定的標準。」凱文皺著眉頭,這太讓他迷惑不解。
「能否解釋一下?」希亞好奇的問。
「它與宗教沒必然聯繫,與年齡、性別、種族、教育都沒必然聯繫,甚至監獄裏的罪犯,也出乎意料的有相當比例屬於『純潔』的行列。」
「是奇怪,不過也能理解。」希亞表示,「看看這兩年的宗教界醜聞就知道。梵蒂岡天文學家教父喬治.柯尼公開支持進化論,遭羅馬天主教宗本尼狄克十六世解雇,還有神父同性戀醜聞。據說,中國佛教聖地少林寺方丈釋永信,被傳聞吃肉、包養北京大學女大生、嫖妓。宗教界現在也不是淨土了。」
「怎樣才能從非『純潔』的基因表達狀態轉變成『純潔』的狀態?靠特效藥物嗎?還是做基因治療手術?」
「從目前的技術水準,還無法用治療甲基化藥物或基因手術同時大規模定量調整多個基因。」凱文說。
「難道識別大瘟疫病毒基因表達的『純潔』狀態無法改變麼?」瑪洛麗不解的問。
希亞表達了不同看法:「應該能夠改變的。只要我們的心靈和精神變『純潔』,也許這個基因表達就變了。」
「可是,『純潔』的標準是什麼呀,目前我們一無所知。」凱文無可奈何,「此外,我還要坦白的告訴二位,識別大瘟疫病毒的基因表達當前無法在實驗室中驗證,也就是說,在大瘟疫病毒前,證明『純潔』的人這種基因表達狀態,能啟動免疫系統識別瘟疫病毒,自我產生抗體。所以我的研究報告結論只是推斷,還需最後的證實,才能作出最後結論。」
「為什麼?」
凱文解釋說,對病毒的感染和抗體實驗,都是先在動物身上試驗,成功後才能轉入利用人類臨床試驗。可是,識別大瘟疫病毒的基因表達,因為是人類特有基因,不可能在動物身上注入大量人類基因,然後造出相同的甲基化,進行抗病毒實驗。唯一的驗證方法是直接在活人身上試驗,二戰時德國和日本曾利用戰俘這樣幹過,但這等於謀殺,法律和良心絕對不允許。
「那可怎麼辦!」瑪洛麗望著希亞,希亞望著妻子,又看看凱文教授,凱文教授也看著他倆,現在,這位絕頂聰明的青年科學家也無計可施。(待續)